Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb5O55234 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms