Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlx3O55144 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms