Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms