Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif6O55135 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif6O55135 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif6O55135 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif6O55135 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms