Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap2O55126 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap2O55126 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms