Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms