Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrxO55103 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrxO55103 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrxO55103 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrxO55103 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrxO55103 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrxO55103 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrxO55103 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms