Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc3O55013 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms