Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SlkO54988 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SlkO54988 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SlkO54988 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SlkO54988 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SlkO54988 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SlkO54988 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SlkO54988 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms