Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnk2O54967 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnk2O54967 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1267.1 ms