Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LatO54957 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LatO54957 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LatO54957 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LatO54957 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LatO54957 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LatO54957 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms