Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema6bO54951 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema6bO54951 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms