Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Socs5O54928 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms