Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rdh16O54909 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rdh16O54909 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms