Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DffaO54786 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DffaO54786 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffaO54786 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffaO54786 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffaO54786 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DffaO54786 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DffaO54786 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DffaO54786 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DffaO54786 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DffaO54786 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DffaO54786 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms