Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srpk2O54781 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srpk2O54781 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms