Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sdc4O35988 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sdc4O35988 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms