Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms