Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sp100O35892 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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