Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppfibp2O35711 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppfibp2O35711 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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