Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clk2O35491 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clk2O35491 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clk2O35491 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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