Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Edil3O35474 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Edil3O35474 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Edil3O35474 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Edil3O35474 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms