Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf5O35326 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms