Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Ptpn9O35239 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ptpn9O35239 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ptpn9O35239 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Ptpn9O35239 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ptpn9O35239 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn9O35239 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Ptpn9O35239 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ptpn9O35239 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Ptpn9O35239 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms