Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ebi3O35228 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ebi3O35228 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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