Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd9O35177 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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