Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfra3O35118 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfra3O35118 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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