Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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