Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GclmO09172 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GclmO09172 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GclmO09172 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GclmO09172 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GclmO09172 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GclmO09172 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GclmO09172 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GclmO09172 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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GclmO09172 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GclmO09172 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GclmO09172 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GclmO09172 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GclmO09172 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GclmO09172 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GclmO09172 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GclmO09172 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms