Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Casq1O09165 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Casq1O09165 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casq1O09165 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms