Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NumblO08919 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NumblO08919 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NumblO08919 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NumblO08919 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NumblO08919 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NumblO08919 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NumblO08919 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NumblO08919 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NumblO08919 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms