Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eftud2O08810 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms