Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ClockO08785 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ClockO08785 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ClockO08785 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ClockO08785 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ClockO08785 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClockO08785 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms