Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MttpO08601 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MttpO08601 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MttpO08601 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MttpO08601 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MttpO08601 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms