Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsmbO08540 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms