Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp35M0QWN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms