Protein–RNA interactions for Protein: M0QWJ9

Tmem178b, Transmembrane protein 178B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem178bM0QWJ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem178bM0QWJ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem178bM0QWJ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms