Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r80L7N1Z3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms