Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21310J3QQ23 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21310J3QQ23 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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