Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lipo1J3QME6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms