Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3727J3QM54 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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