Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip12G5E870 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms