Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nccrp1G3X9C2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms