Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubap1lG3UW59 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubap1lG3UW59 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms