Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Farp1F8VPU2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Farp1F8VPU2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms