Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ttc37F8VPK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc37F8VPK0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc37F8VPK0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms