Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28048F7BCN0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28048F7BCN0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms