Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8220F6YKI2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms