Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17093F6XGJ4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17093F6XGJ4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms