Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17555F6U8B9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm17555F6U8B9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms